.... 基于整體的中藥方劑的藥物代謝研究與系統生物學整合研究思路-中...
翟興等
摘要：目的 探討我國近10余年的中醫藥系統生物學研究狀況，為科研工作者提供參考。方法 對我國正式發表的中醫藥系統生物學文獻進行檢索和篩選，分別從年度變化、地區分布、研究機構、來源期刊、研究領域等方面進行分析。結果 我國中醫藥系統生物學文獻總量呈上升趨勢，研究主要分布于中藥化學物質組學、中醫藥基因組學、中醫藥蛋白質組學、中醫藥代謝組學和中醫藥信息學等領域，北京、廣東、上海等地的研究處于領先地位。結論 我國對中醫藥系統生物學的研究文獻呈逐年上升趨勢，對該學科的認識不斷提高。
關鍵詞：中醫藥；系統生物學；發展動態；文獻計量學
中圖分類號：R2-05 文獻標識碼：A 文章編號：1005-5304（2014）04-0013-04
系統生物學是研究一個生物系統中所有組成成分（基因、蛋白質、代謝物等）的構成，以及在特定條件，如遺傳的、環境的因素變化時，分析這些組分間相互關系的學科[1]。中醫藥同樣是一個復雜的巨系統，中醫藥傳統理論最具特色的就是“整體觀”、“動態觀”、“辨證觀”，與系統生物學的研究思路不謀而合。積極引入系統生物學等新思路新方法，將可能成為推動中醫藥現代化探索的一個突破口[2]。本研究采用文獻計量學方法，對我國中醫藥系統生物學領域相關文獻從年度變化、地區分布、研究機構、來源期刊、研究領域等方面進行統計分析，旨在了解該領域的研究現狀和發展趨勢，為后續的研究提供參考。
1 資料與方法
1.1 數據來源
納入分析的文獻來自中國期刊全文數據庫（CNKI）、中文科技期刊數據庫（VIP）、中國博士學位論文全文數據庫（CDFD）、中國優秀碩士學位論文全文數據庫（CMFD）。
1.2 檢索策略
選擇與系統生物學相關的自由詞“系統生物學”、“生物信息學”、“生物網絡”、“基因組學”、“蛋白質組學”、“代謝組學”、“比較基因組學”，另外選擇與中醫藥相關的自由詞“中醫”、“中藥”、“中草藥”、“針灸”、“方劑”、“復方”、“配伍”、“性味”、“辨證”、“證候”。檢索式：（“系統生物學”or“生物信息學”or“生物網絡”or“基因組學”or“蛋白質組學”or“代謝組學”or“比較基因組學”）and（“中醫”or“中藥”or“中草藥”or“針灸”or“針刺”or“方劑”or“復方”or“配伍”or“性味”or“辨證”or“證候”）。檢索時間范圍：2000年1月-2012年12月。
1.3 納入與排除標準
本研究納入的文獻均為涉及系統生物學和中醫藥交叉學科的國內期刊、會議論文和學位論文；若內容有雷同，經判斷為同一研究后，選擇資料最完整的文獻。剔除：①通知、短訊、動態、消息、新聞報道等；②不屬于系統生物學和中醫藥相關研究的文獻；③資料來源不清、主要數據缺失的文獻。
1.4 統計分析
檢索結果為文獻全文，經過人工整理、拆分，提取文獻的題名、發表年代、作者、研究機構、期刊名稱、主題詞等內容并錄入Excel進行統計。文獻逐年發表量采用SPSS17.0統計軟件進行相關分析和回歸分析。高被引文獻采用普賴斯定律 確定（Mp為高被引論文被引頻次的最小值，Npmax為被引頻次最高論文的被引頻次）[3]。
2 結果
對下載的所有文獻進行數據的篩選和清理后，共納入文獻1348篇，其中期刊論文760篇、會議論文243篇、學位論文345篇。
2.1 文獻年度發表量分析
結果顯示，2000-2004年我國中醫藥系統生物學文獻增長緩慢，且平均每年只有大約70個研究機構參與研究。2005年后逐漸增多，發文數量和發文機構均呈現快速增長趨勢。見表1。
2.2 文獻發表地區分析
按照文獻中提取的發文機構所在的地理位置來確定發表文章的地區，并使用地區發文總數、地區單獨發文數、地區合作發文數3個指標來分析不同地區的文獻分布。經統計，發文最多的是北京（346篇），最少的是海南（1篇）。發文總數排名前10的地區見表2。1348篇文獻中由多個地區合作完成的文獻有251篇，占總文獻數的18.6%，由一個地區單獨完成的文獻數為1097篇，占總文獻數的81.3%。地區單獨發文數最高的是北京（283篇，20.9%），其次是廣東（163，12.1%）和上海（108篇，8.0%）；在多地區合作完成的文獻中排名前3位的是北京（63篇，4.7%）、廣東（39篇，2.9%）和上海（30篇，2.2%）。說明北京、廣東、上海為我國中醫藥系統生物學研究的核心地區。發文量高的4個地區增長趨勢見圖1。
2.3 文獻發表機構分析
按照文獻中提取的作者所在單位來確定發表文章的研究機構（同一機構的不同部門、更名機構、合并機構計為一種）。經統計，1348篇文獻出自367個研究機構。使用機構發文總數、機構單獨發文數、機構間合作發文數3個指標來分析不同機構的文獻分布。發文總數排前10位的機構見表3。單個機構發表的文獻數為1007篇（74.7%），機構間合作的文獻數為341篇（25.3%）。雖然從文章總量上來看單個機構的發文數量遠遠大于機構間合作發文數量，但是從圖2所示的增長趨勢圖可以看出，2008年后單個機構的文章增長率呈下降趨勢，而機構間合作的文章增長率卻一直呈總體上升趨勢。
2.4 文獻發表期刊分析
1348篇中醫藥系統生物學文獻分別發表在225種期刊上（更名期刊1種），其中發文總量排在前3名的期刊分別為《世界科學技術-中醫藥現代化》53篇，《中國中西醫結合雜志》34篇，《中華中醫藥學刊》32篇。收錄文獻≥20篇的共有9種期刊，見表5。這些期刊雖然只占全部期刊的4%，但其載文量卻占總文獻量的18.6%，是發表中醫藥系統生物學的核心期刊。
2.5 文獻關鍵詞分析endprint
科技論文的關鍵詞是能反映論文主題概念的詞或詞組。我們提取到1348篇文章的關鍵詞共7231個。通過合并相同的關鍵詞（如“NEI”和“神經內分泌免疫”），我們對關鍵詞重新進行了整理，選擇最能代表其含義的詞語納入統計。出現頻率最高的30個關鍵詞見表5。
2.6 基金資助情況
1348篇文獻中有512篇獲得了基金資助，占論文總數的38.0%。其中獲得國家級基金支持的有275篇，占基金資助論文的53.7%，占論文總數的20.4%，獲得省、市級基金支持的有202篇（39.4%，14.9%），獲得其他基金支持的有35篇（2.6%）。
2.7 高被引文獻情況分析
根據普賴斯定律可以算出在納入統計的文獻中被引頻次≥9的為高被引文獻（Mp=9.38，Npmax=157）。1348篇文獻中被引頻次≥9的論文共188篇。高被引論文排名前10位的文獻見表6。
3 討論
通過對上述我國中醫藥系統生物學相關文獻的分析我們發現，截止到2012年，中醫藥系統生物學說研究文獻積累量-時間曲線符合線性增長規律，中醫藥系統生物學研究文獻的數量維持一個固定的文獻增長量，形成了本研究領域的核心研究地區、核心研究機構和核心期刊等。
從文獻年度發表量來看，2000-2012年中醫藥系統生物學的發展分為兩個階段。第一階段是2000-2004年，為文獻的平穩增長期，此階段文獻增長緩慢，年均發文量32.2篇；第二階段是2005-2012年，為文獻的“快速增長期”，年均發文量驟增為148.3篇。
從文獻發表地區和研究機構來看，北京、廣東、上海無論是從發文總數、地區單獨發文數，還是地區合作發文數來看，都是排在前3名的地區，說明北京、廣東、上海為我國中醫藥系統生物學研究的核心地區。廣州中醫藥大學、北京中醫藥大學和中國中醫科學院是發文量最高的3個機構，在地理上位于發文量前2名的北京和廣東地區。排名前10的研究機構，大多數為中醫藥類大學和研究機構，說明對中醫藥系統生物學的研究以大學和科研機構為主。另外，各個研究機構間合作發文的數量在逐年增長，說明一方面有越來越多的研究機構參與到中醫藥系統生物學的研究中，另一方面各個機構間的技術合作和交流正逐步加強。
從文獻中提取出的出現頻率最高的30個關鍵詞中可以看出，大部分關鍵詞都屬于中藥化學物質組學、中醫藥基因組學、中醫藥蛋白質組學、中醫藥代謝組學、中醫藥信息學等研究領域，說明這5個領域是我國中醫藥系統生物學的研究熱點。從基金資助情況來看，中醫藥系統生物學研究已經在國家和省市層面上受到了高度的關注，且研究正逐年深入。通過高被引文獻的分析可以看出，清華大學雖然發表的相關文獻總數不多，但是質量卻很高。這說明清華大學作為傳統中醫藥類大學和研究機構之外的另一股重要力量，正在對中醫藥系統生物學的研究發揮著越來越重要的作用。
總之，經過十幾年的發展和積淀，國內對中醫藥系統生物學的認識不斷提高，并且達到了一定的研究水平，形成了以中藥化學物質組學、中醫藥基因組學、中醫藥蛋白質組學、中醫藥代謝組學、中醫藥信息學為主的研究方向，而對其進一步的研究，必將為中醫藥現代化注入新的活力，從而推動中醫藥學以及未來系統生物醫學的發展。
參考文獻：
[1] Hood L. A personal view of molecular technology and how it has changed biology[J]. J Proteome Res，2002，1（5）：399-409.
[2] 王永炎.系統生物學與中醫藥的發展——中醫藥研究中系統論與還原論的關聯關系[J].世界科學技術-中醫藥現代化，2007，9（1）：70-73.
[3] 劉雪立，王兆軍.2004-2008年我國情報專題研究高被引論文的統計與分析[J].情報雜志，2010，29（1）：64-67.
（收稿日期：2013-08-07，編輯：華強）endprint
科技論文的關鍵詞是能反映論文主題概念的詞或詞組。我們提取到1348篇文章的關鍵詞共7231個。通過合并相同的關鍵詞（如“NEI”和“神經內分泌免疫”），我們對關鍵詞重新進行了整理，選擇最能代表其含義的詞語納入統計。出現頻率最高的30個關鍵詞見表5。
2.6 基金資助情況
1348篇文獻中有512篇獲得了基金資助，占論文總數的38.0%。其中獲得國家級基金支持的有275篇，占基金資助論文的53.7%，占論文總數的20.4%，獲得省、市級基金支持的有202篇（39.4%，14.9%），獲得其他基金支持的有35篇（2.6%）。
2.7 高被引文獻情況分析
根據普賴斯定律可以算出在納入統計的文獻中被引頻次≥9的為高被引文獻（Mp=9.38，Npmax=157）。1348篇文獻中被引頻次≥9的論文共188篇。高被引論文排名前10位的文獻見表6。
3 討論
通過對上述我國中醫藥系統生物學相關文獻的分析我們發現，截止到2012年，中醫藥系統生物學說研究文獻積累量-時間曲線符合線性增長規律，中醫藥系統生物學研究文獻的數量維持一個固定的文獻增長量，形成了本研究領域的核心研究地區、核心研究機構和核心期刊等。
從文獻年度發表量來看，2000-2012年中醫藥系統生物學的發展分為兩個階段。第一階段是2000-2004年，為文獻的平穩增長期，此階段文獻增長緩慢，年均發文量32.2篇；第二階段是2005-2012年，為文獻的“快速增長期”，年均發文量驟增為148.3篇。
從文獻發表地區和研究機構來看，北京、廣東、上海無論是從發文總數、地區單獨發文數，還是地區合作發文數來看，都是排在前3名的地區，說明北京、廣東、上海為我國中醫藥系統生物學研究的核心地區。廣州中醫藥大學、北京中醫藥大學和中國中醫科學院是發文量最高的3個機構，在地理上位于發文量前2名的北京和廣東地區。排名前10的研究機構，大多數為中醫藥類大學和研究機構，說明對中醫藥系統生物學的研究以大學和科研機構為主。另外，各個研究機構間合作發文的數量在逐年增長，說明一方面有越來越多的研究機構參與到中醫藥系統生物學的研究中，另一方面各個機構間的技術合作和交流正逐步加強。
從文獻中提取出的出現頻率最高的30個關鍵詞中可以看出，大部分關鍵詞都屬于中藥化學物質組學、中醫藥基因組學、中醫藥蛋白質組學、中醫藥代謝組學、中醫藥信息學等研究領域，說明這5個領域是我國中醫藥系統生物學的研究熱點。從基金資助情況來看，中醫藥系統生物學研究已經在國家和省市層面上受到了高度的關注，且研究正逐年深入。通過高被引文獻的分析可以看出，清華大學雖然發表的相關文獻總數不多，但是質量卻很高。這說明清華大學作為傳統中醫藥類大學和研究機構之外的另一股重要力量，正在對中醫藥系統生物學的研究發揮著越來越重要的作用。
總之，經過十幾年的發展和積淀，國內對中醫藥系統生物學的認識不斷提高，并且達到了一定的研究水平，形成了以中藥化學物質組學、中醫藥基因組學、中醫藥蛋白質組學、中醫藥代謝組學、中醫藥信息學為主的研究方向，而對其進一步的研究，必將為中醫藥現代化注入新的活力，從而推動中醫藥學以及未來系統生物醫學的發展。
參考文獻：
[1] Hood L. A personal view of molecular technology and how it has changed biology[J]. J Proteome Res，2002，1（5）：399-409.
[2] 王永炎.系統生物學與中醫藥的發展——中醫藥研究中系統論與還原論的關聯關系[J].世界科學技術-中醫藥現代化，2007，9（1）：70-73.
[3] 劉雪立，王兆軍.2004-2008年我國情報專題研究高被引論文的統計與分析[J].情報雜志，2010，29（1）：64-67.
（收稿日期：2013-08-07，編輯：華強）endprint
科技論文的關鍵詞是能反映論文主題概念的詞或詞組。我們提取到1348篇文章的關鍵詞共7231個。通過合并相同的關鍵詞（如“NEI”和“神經內分泌免疫”），我們對關鍵詞重新進行了整理，選擇最能代表其含義的詞語納入統計。出現頻率最高的30個關鍵詞見表5。
2.6 基金資助情況
1348篇文獻中有512篇獲得了基金資助，占論文總數的38.0%。其中獲得國家級基金支持的有275篇，占基金資助論文的53.7%，占論文總數的20.4%，獲得省、市級基金支持的有202篇（39.4%，14.9%），獲得其他基金支持的有35篇（2.6%）。
2.7 高被引文獻情況分析
根據普賴斯定律可以算出在納入統計的文獻中被引頻次≥9的為高被引文獻（Mp=9.38，Npmax=157）。1348篇文獻中被引頻次≥9的論文共188篇。高被引論文排名前10位的文獻見表6。
3 討論
通過對上述我國中醫藥系統生物學相關文獻的分析我們發現，截止到2012年，中醫藥系統生物學說研究文獻積累量-時間曲線符合線性增長規律，中醫藥系統生物學研究文獻的數量維持一個固定的文獻增長量，形成了本研究領域的核心研究地區、核心研究機構和核心期刊等。
從文獻年度發表量來看，2000-2012年中醫藥系統生物學的發展分為兩個階段。第一階段是2000-2004年，為文獻的平穩增長期，此階段文獻增長緩慢，年均發文量32.2篇；第二階段是2005-2012年，為文獻的“快速增長期”，年均發文量驟增為148.3篇。
從文獻發表地區和研究機構來看，北京、廣東、上海無論是從發文總數、地區單獨發文數，還是地區合作發文數來看，都是排在前3名的地區，說明北京、廣東、上海為我國中醫藥系統生物學研究的核心地區。廣州中醫藥大學、北京中醫藥大學和中國中醫科學院是發文量最高的3個機構，在地理上位于發文量前2名的北京和廣東地區。排名前10的研究機構，大多數為中醫藥類大學和研究機構，說明對中醫藥系統生物學的研究以大學和科研機構為主。另外，各個研究機構間合作發文的數量在逐年增長，說明一方面有越來越多的研究機構參與到中醫藥系統生物學的研究中，另一方面各個機構間的技術合作和交流正逐步加強。
從文獻中提取出的出現頻率最高的30個關鍵詞中可以看出，大部分關鍵詞都屬于中藥化學物質組學、中醫藥基因組學、中醫藥蛋白質組學、中醫藥代謝組學、中醫藥信息學等研究領域，說明這5個領域是我國中醫藥系統生物學的研究熱點。從基金資助情況來看，中醫藥系統生物學研究已經在國家和省市層面上受到了高度的關注，且研究正逐年深入。通過高被引文獻的分析可以看出，清華大學雖然發表的相關文獻總數不多，但是質量卻很高。這說明清華大學作為傳統中醫藥類大學和研究機構之外的另一股重要力量，正在對中醫藥系統生物學的研究發揮著越來越重要的作用。
總之，經過十幾年的發展和積淀，國內對中醫藥系統生物學的認識不斷提高，并且達到了一定的研究水平，形成了以中藥化學物質組學、中醫藥基因組學、中醫藥蛋白質組學、中醫藥代謝組學、中醫藥信息學為主的研究方向，而對其進一步的研究，必將為中醫藥現代化注入新的活力，從而推動中醫藥學以及未來系統生物醫學的發展。
參考文獻：
[1] Hood L. A personal view of molecular technology and how it has changed biology[J]. J Proteome Res，2002，1（5）：399-409.
[2] 王永炎.系統生物學與中醫藥的發展——中醫藥研究中系統論與還原論的關聯關系[J].世界科學技術-中醫藥現代化，2007，9（1）：70-73.
[3] 劉雪立，王兆軍.2004-2008年我國情報專題研究高被引論文的統計與分析[J].情報雜志，2010，29（1）：64-67.
（收稿日期：2013-08-07，編輯：華強）endprint
